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목록primer design (1)
Self Love is the Best Love
5. MSA, consensus sequence, and primer design
1. Purpose 원하는 유전자 서열과 orthologous한 유전자를 탐색하거나, 다른 생물에 원하는 유전자 서열의 유무를 확인하고 싶을 때Orthologous한 유전자의 서열이 이미 알려져 있다면 BLAST를 사용하거나, orthologous gene database를 이용한다. 하지만 서열 정보가 없는 경우 실험을 통해 증명해낸다. 원하는 유전자 서열과 서열 상동성이 유사한 orthologous 유전자의 서열들을 이용해서 MSA(multiple sequence alignment)를 실시하고, consensus sequence를 추출한 다음 이 서열을 이용해서 primer를 design한다면, 다른 생물에서 원하는 유전자 서열과 orthologous한 관계의 유전자 서열의 유무를 확인할 수 있고 다..
20211/생물정보학
2021. 8. 16. 03:07